Partendo dal fatto che è un gioco che non approfondisce in sè la lore.
Può avere senso se le medaglie sono sinomimo di esperienza del giocatore. Quando andavo a cavallo da neofita non mi davano certi esemplari perché richiedevano un abilità maggiore da parte del cavallerizzo e se questo era inesperto veniva ignorato o "buttato giù" quindi i poke a livello alto o evoluti ( e di conseguenza più potenti) possono avere maggiore capacità di ribellarsi al legame della pokeball (dopotutto possono ignorarti mica scappare o ucciderti)
Per riassumere direi che ci sono tre passaggi nel legame:
1) la ball che fa tuo il pokemon e crea la base per il legame
2) l esperienza del giocatore (megaglie) che deve gestire il legame e addomesticarlo
3) l amicizia che porta oltre il legame facendo che il pokemon possa superare i proprio limiti (bonus schivata, cura dai problemi di stato ecc)
Ovviamente è una visione personale ma mi piacerebbe vedere questo concetto approfondito nei giochi (già ci aveva provato N )