Meglio col photoshop, è più facile. Io faccio pixel art usando questo programma da anni, decisamente mooolto comodo. Ho provato con SAI ma troppa confusione :/, meglio col PS.
All'inizio si ma è normale per tutti, con PS è facile perché puoi avere diversi livelli, calibrazione dei colori, saturazione, ha più roba e precisa rispetto a SAI.